Флаг МОУ гимназии №5 г. Екатеринбурга является официальным символом гимназии.

Флаг гимназии представляет собой прямоугольное полотнище из трёх равновеликих горизонтальных полос: верхней - жёлтого цвета, средней - синего и нижней - зелёного цвета. На средней полосе (синей) располагается надпись «Гимназия №5» в жёлтом цвете.

Цвета флага символизируют:

Жёлтый - интеллект

Синий - честь

Зелёный - обновление, рост